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Genómico
Mesada de genética del Laboratorio Aclimu
Guía

Tu genoma, desde cero

Nueve páginas, una por pantalla. Cada una explica algo que vas a necesitar para leer tu informe: qué es una variante, qué mide la ancestralidad, en qué se diferencia una condición mendeliana de una poligénica, y qué es realmente un riesgo.

Bajá para avanzar. Cada rueda pasa a la página siguiente.

01 · Qué es el ADN

Tres mil doscientos millones de letras

Tu ADN es una secuencia de cuatro letras —A, C, G y T— repetida tres mil doscientos millones de veces.

Entre vos y cualquier otra persona, más del 99% de esas letras son idénticas. Todo lo que te distingue vive en el resto. A cada posición donde las personas difieren se la llama variante.

Las dos hebras son las dos copias que heredaste. Coinciden en casi todas las posiciones; las marcadas son las que varían entre personas, y son las que el estudio mide. Tocá una.

Copia materna
Copia paterna
Tu genotipoA/G
rs4988235MCM6 / LCT

decide si la enzima que digiere la lactosa se sigue produciendo después de la infancia.

Cada letra va en el color de su base: A, C, G y T. Las posiciones recuadradas son las que varían entre personas —las que el estudio mide, y las únicas que se pueden tocar—; en todas las demás, las dos copias traen la misma letra.

02 · Dos copias de todo

Tu resultado se escribe siempre de a pares

Esas letras no están sueltas: vienen empaquetadas en 23 pares de cromosomas —46 en total—, y de cada par heredás uno de tu madre y otro de tu padre. Por eso en cada posición tenés dos letras, no una.

Cuando las dos copias son iguales se dice homocigota; cuando son distintas, heterocigota. Toda la genética que viene después se apoya en esa diferencia.

Copia maternaCopia paternaCCC / C · homocigotaCTC / T · heterocigotaTTT / T · homocigota

Las tres combinaciones posibles en una posición donde existen dos versiones. Así es como el informe escribe cada resultado: siempre de a dos letras.

03 · Qué heredás y de dónde viene

Se hereda en bloques, y los bloques se cortan

No heredás letras sueltas: heredás tramos enteros de cromosoma. Antes de pasarte una copia, cada progenitor cruza las suyas dos y arma una mezcla nueva. Ese proceso se llama recombinación homóloga, y ocurre en cada generación.

Como los puntos de corte caen en lugares distintos en cada hijo, con un hermano compartís 50% en promedio —los pares medidos van del 37% al 61%— y el estudio de un familiar no reemplaza el propio.

Y por eso se puede leer de dónde viene cada tramo: la ancestralidad compara esos bloques contra poblaciones de referencia. En Argentina los paneles de poblaciones originarias son más chicos, y ese componente se estima con menos precisión. No es un defecto de tu muestra: es un límite de la ciencia disponible hoy.

En la generación 5:Europa95,7%América originaria4,3%

Cada rama que entra se dibuja como una copia entera de una sola región: es una simplificación, porque una persona real también viene mezclada. Los nombres son regiones de los paneles de referencia, no etnias. Cuando los bloques quedan demasiado cortos dejan de poder asignarse a una región: ahí es donde la ancestralidad pierde precisión.

04 · Por qué existen

Ninguna variante está ahí para hacerte daño

La mayoría de las variantes son el rastro de historias de poblaciones enteras, no errores individuales.

Tres cosas las vuelven frecuentes, y solo la primera tiene que ver con que sirvan para algo. Mirá la forma de cada columna: una sube y se queda, otra zigzaguea sin dirección hasta desaparecer, y la tercera pega un salto el día que un grupo se separa.

El caso más claro es la lactosa: tolerarla de adulto es la variante nueva, y se volvió común solo en las poblaciones que criaron ganado.

Cada casilla es una persona, cada fila una generación; encendida significa que lleva la variante.

20 personas

Selección

Deriva

Efecto fundador

620 de 20
100 de 20
314 de 20se separa el grupo

La variante daba una ventaja. Quienes la llevaban dejaron más descendencia, así que subió y se quedó.

Sin ninguna ventaja detrás. En poblaciones chicas el azar solo alcanza para volver común una variante — o para borrarla, como acá.

Un grupo chico se separa y crece aislado. Lo que llevaba por azar queda sobrerrepresentado para siempre.

Veinte individuos por generación, catorce generaciones de arriba abajo. Los números salen de correr un modelo de Wright-Fisher, el modelo estándar de deriva genética.

05 · Herencia mendeliana

Un solo gen alcanza para decidir el resultado

Un gen es un tramo de esas letras con una instrucción adentro: casi siempre, cómo fabricar una proteína. En una condición mendeliana el resultado depende de un solo gen. Son poco frecuentes, pero cuando la variante está el efecto es contundente y la cuenta es exacta.

La forma más común es la recesiva: hacen falta las dos copias con la variante, o sea que los dos miembros de la pareja tienen que ser portadores. Con una sola copia se es portador sano —sin síntomas y sin consecuencias— y eso es lo que informa la sección de Portadores.

Los padresLos cuatro hijos posiblesAaportadoraAaAaportadorAa×AAsin la varianteAaportador sanoAaportador sanoaacon la condición

Cada círculo de abajo es un hijo posible: hereda una copia de cada progenitor, siguiendo las líneas. Los cuatro casos son igual de probables, y la cuenta vale para cada embarazo por separado.

25% con la condición en cada embarazo
50% portador sano · 25% sin la variante

Con un solo progenitor portador, ningún hijo tiene la condición: todos los que hereden la variante van a ser portadores sanos. Por eso el tamizaje que importa es el de la pareja, no el individual.

Fibrosis quística, atrofia muscular espinal, talasemias.

Probá destildar a uno de los dos progenitores, y cambiar entre recesiva y dominante: son los dos patrones que explica el texto, y el dibujo se rehace con cada uno.

06 · Un ejemplo mendeliano

Una posición decide si digerís la lactosa

La enzima que digiere la lactosa deja de producirse después de la infancia en casi todos los mamíferos, y en buena parte de las personas. Que se siga produciendo de adulto es lo nuevo, y depende de una sola posición.

Es exactamente el mecanismo mendeliano de la página anterior, con una diferencia: acá alcanza una sola copia con la variante para seguir produciendo la enzima. Por eso hay tres resultados y no dos.

Sirve para ver la regla sin la carga de una enfermedad: un gen, tres genotipos posibles, tres resultados que se distinguen.

rs4988235MCM6 / LCTtolerancia a la lactosaDominante · alcanza una copia
Lactasa persistente (intermedia)
Lactasa, la enzimaLactosa: un disacárido, glucosa + galactosa
La carga de lactosa es la misma en los tres genotipos. Con éste, la lactasa disponible hidroliza 3 de 6 porciones; el resto llega sin hidrolizar al intestino grueso, donde la fermenta la microbiota.
Una sola copia de la variante alcanza para seguir produciendo lactasa. En general se tolera, con síntomas posibles ante cargas altas.

Una sola posición del genoma decide las tres, y con el patrón dominante de la página anterior: el heterocigoto —una sola copia con la variante— ya tolera. Por eso este rasgo tiene nivel de evidencia alto: el mecanismo está descripto y el efecto se mide directo.

La misma lógica de la página anterior sobre un rasgo cotidiano en vez de una enfermedad. En el informe esta es la sección de Nutrigenética; el alcohol funciona igual, con ALDH2.

07 · Herencia poligénica

Miles de variantes mínimas, y de ahí sale un percentil

Diabetes, infarto, hipertensión. Acá no decide un gen: miles de variantes aportan un empujón mínimo cada una, sobre todo lo que no es genético.

Muchos efectos chicos e independientes se suman siempre en la misma forma, una campana, así que acá no hay una cuenta exacta como el 25 % del cuadro de cruzamiento: hay una posición. El puntaje suma el peso de cada variante que llevás, se compara contra una población de referencia, y eso da un percentil. Contra cuál población importa: la enorme mayoría de estos puntajes se ajustó en cohortes de ascendencia europea, y transfieren peor a poblaciones mezcladas como las sudamericanas. Tu informe ajusta el percentil por tu ascendencia medida y dice, puntaje por puntaje, cuánto de ella está representada.

Fijate en el ancho de la banda: el percentil viene con un intervalo, y el informe lo muestra siempre. En población general el riesgo de por vida de esta condición es 10,5% — por eso el informe habla de cuántas personas de cien y no de cuántas veces más: «el doble» puede ser de 2 a 4 de cada 100, o de 30 a 60.

Diabetes tipo 2las mejor descriptas
genotipoqué aporta en este caso
  1. TCF7L2×1,40
  2. CDKN2A/B×1,20×1,20
  3. FTO×1,17
  4. KCNJ11no multiplica
  5. IGF2BP2×1,14
  6. PPARG×1,14×1,14
Cuánto multiplican juntas estas seis×3,49
×1,00×8,48

×8,48 es el tope de estas seis en doble copia, no el del puntaje.

…y 1.068.160 más en el puntaje, casi todas más chicas que la última de la lista.

La letra resaltada es la variante, y multiplica una vez por cada copia. Tocá cualquier genotipo para cambiarlo.

el caso del informe de ejemplo
1025507590percentil 786687percentil en la población

Percentil 78: 78 de cada 100 personas de ancestralidad similar tienen un puntaje más bajo. La campana no cambia al tocar los genotipos de arriba: el percentil sale de un millón de posiciones con sus frecuencias en la población, no de estas seis. No es una probabilidad — es una posición, con un intervalo de 66 a 87 encima.

Cada número es por cuánto multiplica el riesgo una copia de esa variante, según estudios replicados. No son las que componen el puntaje: son las mejor descriptas del rasgo.

08 · Cuánto respaldo tiene

No todos los hallazgos valen lo mismo, y el informe lo dice

Cada hallazgo del informe llega con una letra al lado. No es un adorno: es cuánto respaldo tiene esa afirmación, y cambia por completo qué se puede hacer con ella.

En A hay una guía profesional que dice qué hacer, y por eso farmacogenómica y portadores pueden cambiar una conducta médica. En B la asociación es firme pero agrega poco sobre lo que ya se sabe por la clínica.

En C el hallazgo está replicado y aun así nadie demostró que conocerlo mejore un resultado. Y en D es exploratorio: interesante, sin implicancia clínica.

  1. A
    Uso clínico establecidoFarmacogenómica · Portadores · parte de Nutrigenética

    Hay una guía profesional que indica qué hacer.

    Clopidogrel y CYP2C19: la guía CPIC dice cuándo conviene otro antiagregante.

  2. B
    Respaldo sólidoAncestralidad · Riesgo poligénico

    La asociación es firme, pero aporta poco sobre lo que ya se sabe por la clínica.

    Diabetes tipo 2: el percentil es firme, y aun así la edad y el peso pesan más.

  3. C
    Sin cambio de conducta demostradoParte de Nutrigenética

    Replicado, sin evidencia de que conocerlo mejore un resultado.

    Metabolismo de la cafeína: replicado, sin evidencia de que saberlo cambie nada.

  4. D
    ExploratorioDeporte · Piel · Longevidad

    Sin implicancia clínica. Va por interés, no por utilidad.

    Tipo de fibra muscular: se asocia a un perfil, y el entrenamiento pesa mucho más.

La barra mide cuánto respaldo hay detrás de cada peldaño. No son cuatro cajones equivalentes: entre el primero y el último hay una caída real, y el informe la declara en vez de presentarlo todo igual.

La letra que acompaña a cada resultado dice al lado qué está midiendo, porque no es lo mismo en todas las secciones: acá y en fármacos mide accionabilidad; en Predisposiciones y Portadores, la confianza de revisión de esa variante en ClinVar; en Riesgo poligénico, cuánto del puntaje depende de la ancestría. Leé siempre la letra con su texto.

La misma variante puede aparecer con nivel A en una sección y con nivel D en otra: lo que cambia no es la variante sino cuánta evidencia hay detrás de lo que se afirma sobre ella.

09 · Deporte, piel y longevidad

La parte que está para mirar, no para decidir

Tipo de fibra muscular, respuesta de la piel al sol, percepción del sabor amargo. Están en el informe porque son interesantes, y porque a mucha gente le da curiosidad ver qué dice su genoma sobre cosas cotidianas.

También están declarados en nivel D, que es donde corresponde: el efecto de cada variante es minúsculo y los estudios que las respaldan son chicos o no se replicaron. Un resultado de acá no habilita ninguna decisión, y el informe lo dice antes de mostrarlo.

Las dos cosas son ciertas a la vez, y por eso la sección existe y viene cerrada: se puede disfrutar algo sabiendo que no significa mucho. Lo que no se puede es presentarlo con el mismo peso que una interacción con un medicamento.

  • Tipo de fibra muscular

    R / X
    Mixto

    Una copia de cada variante. Se asocia a un perfil intermedio entre fuerza y resistencia, con un efecto chico frente al entrenamiento.

    Nivel D · exploratorioACTN3
  • Percepción del sabor amargo

    PAV / AVI
    Percibe

    Detecta el amargor de compuestos como el del brócoli. Es el rasgo con el que se descubrió que el gusto tiene una base genética.

    Nivel D · exploratorioTAS2R38
  • Sensibilidad al daño solar

    C / T
    Aumentada

    Se asocia a piel que se quema antes. El protector solar y la sombra mueven esto muchísimo más que la variante.

    Nivel D · exploratorioMC1R
  • Cafeína como ayuda ergogénica

    A / A
    Metabolizador rápido

    En metabolizadores rápidos se describió algo de beneficio en resistencia. La evidencia es chica y no se replicó siempre.

    Nivel D · exploratorioCYP1A2
  • Grosor del pelo

    T / T
    Pelo más fino

    La variante que engrosa el pelo es frecuente en Asia oriental y en poblaciones originarias americanas. Esta muestra no la lleva.

    Nivel D · exploratorioEDAR
  • Tipo de cerumen y olor corporal

    G / G
    Cerumen húmedo

    Una sola posición decide las dos cosas a la vez, porque el mismo transportador está en la piel y en el oído. Es de los pocos rasgos donde una variante explica casi todo.

    Nivel D · exploratorioABCC11

Así aparecen en tu informe, con el nivel declarado adelante. Los resultados del ejemplo son ficticios.

Así aparecen en tu informe: la sección viene cerrada, con el nivel declarado adelante, y se abre solo si querés. Los resultados del ejemplo son ficticios.

Para seguir

Todo esto está en tu informe, y declarado

Cada hallazgo lleva su nivel de evidencia, cada sección declara cuánto la cubre el chip, y lo que no se pudo medir aparece con el motivo en vez de omitirse.

Reservar el estudio $159.000

Pagás en línea y la muestra se toma en la sede.