Três bilhões e duzentos milhões de letras
O seu DNA é uma sequência de quatro letras —A, C, G e T— repetida três bilhões e duzentos milhões de vezes.
Entre você e qualquer outra pessoa, mais de 99% dessas letras são idênticas. Tudo o que te distingue vive no resto. Cada posição onde as pessoas diferem é chamada de variante.
As duas fitas são as duas cópias que você herdou. Coincidem em quase todas as posições; as marcadas são as que variam entre as pessoas, e são essas as que o exame mede. Toque em uma.
determina se a enzima que digere a lactose continua sendo produzida depois da infância.
Cada letra vai na cor da sua base: A, C, G e T. As posições destacadas são as que variam entre pessoas —as que o exame mede, e as únicas em que dá para tocar—; em todas as demais, as duas cópias trazem a mesma letra.
O seu resultado é sempre escrito em pares
Essas letras não estão soltas: vêm empacotadas em 23 pares de cromossomos —46 no total—, e de cada par você herda um da sua mãe e outro do seu pai. Por isso, em cada posição, você tem duas letras, não uma.
Quando as duas cópias são iguais, diz-se homozigoto; quando são diferentes, heterozigoto. Toda a genética que vem depois se apoia nessa diferença.
As três combinações possíveis em uma posição onde existem duas versões. É assim que o laudo escreve cada resultado: sempre com duas letras.
Herda-se em blocos, e os blocos são cortados
Você não herda letras soltas: herda trechos inteiros de cromossomo. Antes de passar uma cópia para você, cada progenitor cruza as suas duas cópias e monta uma mistura nova. Esse processo se chama recombinação homóloga, e ocorre em cada geração.
Como os pontos de corte caem em lugares diferentes em cada filho, com um irmão você compartilha 50% em média —os pares medidos vão de 37% a 61%— e o exame de um familiar não substitui o próprio.
E é por isso que dá para ler de onde vem cada trecho: a ancestralidade compara esses blocos contra populações de referência. Na Argentina, os painéis de populações indígenas são menores, e esse componente é estimado com menos precisão. Não é um defeito da sua amostra: é um limite da ciência disponível hoje.
Cada ramo que entra é desenhado como uma cópia inteira de uma única região: é uma simplificação, porque uma pessoa real também vem misturada. Os nomes são regiões dos painéis de referência, não etnias. Quando os blocos ficam curtos demais, deixam de poder ser atribuídos a uma região: é aí que a ancestralidade perde precisão.
Nenhuma variante está ali para te fazer mal
A maioria das variantes é o rastro de histórias de populações inteiras, não erros individuais.
Três coisas as tornam frequentes, e só a primeira tem a ver com serem úteis para alguma coisa. Olhe a forma de cada coluna: uma sobe e permanece, outra ziguezagueia sem direção até desaparecer, e a terceira dá um salto no dia em que um grupo se separa.
O caso mais claro é a lactose: tolerá-la na idade adulta é a variante nova, e ela se tornou comum apenas nas populações que criaram gado.
Cada quadrado é uma pessoa, cada linha uma geração; aceso significa que ela carrega a variante.
Seleção
Deriva genética
Efeito fundador
A variante dava uma vantagem. Quem a carregava deixou mais descendentes, então ela subiu e ficou.
Sem nenhuma vantagem por trás. Em populações pequenas o acaso sozinho basta para tornar uma variante comum — ou para apagá-la, como aqui.
Um grupo pequeno se separa e cresce isolado. O que ele carregava por acaso fica sobrerrepresentado para sempre.
Vinte indivíduos por geração, catorze gerações de cima a baixo. Os números vêm de rodar um modelo de Wright-Fisher, o modelo padrão de deriva genética.
Um único gene basta para decidir o resultado
Um gene é um trecho dessas letras com uma instrução dentro: quase sempre, como fabricar uma proteína. Em uma condição mendeliana o resultado depende de um único gene. São pouco frequentes, mas quando a variante está presente o efeito é decisivo e a conta é exata.
A forma mais comum é a recessiva: são necessárias as duas cópias com a variante, ou seja, os dois membros do casal precisam ser portadores. Com uma única cópia a pessoa é portadora saudável —sem sintomas e sem consequências— e é isso que a seção Portadores reporta.
Cada círculo de baixo é um filho possível: herda uma cópia de cada progenitor, seguindo as linhas. Os quatro casos são igualmente prováveis, e a conta vale para cada gravidez separadamente.
Com apenas um dos pais portador, nenhum filho tem a condição: todos os que herdarem a variante serão portadores saudáveis. Por isso a triagem que importa é a do casal, não a individual.
Fibrose cística, atrofia muscular espinhal, talassemias.
Experimente desmarcar um dos dois progenitores, e alternar entre recessiva e dominante: são os dois padrões que o texto explica, e o desenho se refaz com cada um.
Uma posição decide se você digere lactose
A enzima que digere a lactose deixa de ser produzida depois da infância em quase todos os mamíferos, e em boa parte das pessoas. Que ela continue sendo produzida na idade adulta é o que é novo, e depende de uma única posição.
É exatamente o mecanismo mendeliano da página anterior, com uma diferença: aqui basta uma única cópia com a variante para continuar produzindo a enzima. Por isso há três resultados e não dois.
Serve para ver a regra sem o peso de uma doença: um gene, três genótipos possíveis, três resultados que se distinguem.
Uma única posição do genoma decide as três, e com o padrão dominante da página anterior: o heterozigoto —uma só cópia com a variante— já tolera. Por isso esta característica tem nível de evidência alto: o mecanismo está descrito e o efeito é medido diretamente.
A mesma lógica da página anterior sobre uma característica cotidiana em vez de uma doença. No laudo, esta é a seção de Nutrigenética; o álcool funciona igual, com ALDH2.
Milhares de variantes mínimas, e daí sai um percentil
Diabetes, infarto, hipertensão. Aqui não é um gene que decide: milhares de variantes contribuem com um empurrão mínimo cada uma, sobre tudo o que não é genético.
Muitos efeitos pequenos e independentes somam-se sempre na mesma forma, um sino, então aqui não há uma conta exata como os 25 % do quadro de cruzamento: há uma posição. O escore soma o peso de cada variante que você carrega, é comparado com uma população de referência, e isso dá um percentil. Contra qual população importa: a enorme maioria destes escores foi ajustada em coortes de ancestralidade europeia, e transferem pior para populações miscigenadas como as sul-americanas. O seu laudo ajusta o percentil pela sua ancestralidade medida e diz, escore por escore, o quanto dela está representado.
Repare na largura da faixa: o percentil vem com um intervalo, e o laudo sempre o mostra. Na população geral, o risco ao longo da vida desta condição é 10,5% — por isso o laudo fala de quantas pessoas em cem e não de quantas vezes mais: “o dobro” pode ser de 2 a 4 em cada 100, ou de 30 a 60.
- TCF7L2rs7903146×1,40
- CDKN2A/Brs10811661×1,20×1,20
- FTOrs8050136×1,17
- KCNJ11rs5219não multiplica
- IGF2BP2rs4402960×1,14
- PPARGrs1801282×1,14×1,14
×8,48 é o teto destas seis em cópia dupla, não o do escore.
…e 1.068.160 mais no escore, quase todas menores que a última da lista.
A letra destacada é a variante, e multiplica uma vez por cada cópia. Toque em qualquer genótipo para alterá-lo.
Percentil 78: 78 de cada 100 pessoas de ancestralidade semelhante têm um escore mais baixo. O sino não muda ao tocar nos genótipos acima: o percentil sai de um milhão de posições com as suas frequências na população, não destas seis. Não é uma probabilidade — é uma posição, com um intervalo de 66 a 87 por cima.
Cada número é por quanto uma cópia dessa variante multiplica o risco, segundo estudos replicados. Não são as que compõem o escore: são as mais bem descritas do traço.
Nem todos os achados valem o mesmo, e o laudo diz isso
Cada achado do laudo vem com uma letra ao lado. Não é um enfeite: é quanto respaldo aquela afirmação tem, e muda por completo o que se pode fazer com ela.
Em A há uma diretriz profissional que diz o que fazer, e por isso farmacogenômica e portadores podem mudar uma conduta médica. Em B a associação é firme, mas acrescenta pouco ao que já se sabe pela clínica.
Em C o achado está replicado e, ainda assim, ninguém demonstrou que conhecê-lo melhore um desfecho. E em D é exploratório: interessante, sem implicação clínica.
- AUso clínico estabelecidoFarmacogenômica · Portadores · parte da Nutrigenética
Existe uma diretriz profissional que indica o que fazer.
Clopidogrel e CYP2C19: a diretriz CPIC diz quando convém outro antiagregante.
- BRespaldo sólidoAncestralidade · Risco poligênico
A associação é firme, mas acrescenta pouco ao que já se sabe pela avaliação clínica.
Diabetes tipo 2: o percentil é firme, e ainda assim a idade e o peso pesam mais.
- CSem mudança de conduta demonstradaParte da Nutrigenética
Replicado, sem evidência de que conhecê-lo melhore um desfecho.
Metabolismo da cafeína: replicado, sem evidência de que sabê-lo mude algo.
- DExploratórioEsporte · Pele · Longevidade
Sem implicação clínica. Entra por interesse, não por utilidade.
Tipo de fibra muscular: associa-se a um perfil, e o treino pesa muito mais.
A barra mede quanto respaldo há por trás de cada degrau. Não são quatro caixas equivalentes: entre a primeira e a última há uma queda real, e o laudo a declara em vez de apresentar tudo igual.
A letra ao lado de cada resultado diz ali mesmo o que está medindo, porque não é a mesma coisa em todas as seções: aqui e nos fármacos mede acionabilidade; em Predisposições e Portadores, a confiança de revisão daquela variante no ClinVar; no Risco poligênico, quanto do escore depende da ancestralidade. Leia sempre a letra junto com o seu texto.
A mesma variante pode aparecer com nível A em uma seção e com nível D em outra: o que muda não é a variante, e sim quanta evidência há por trás do que se afirma sobre ela.
A parte que é para olhar, não para decidir
Tipo de fibra muscular, resposta da pele ao sol, percepção do sabor amargo. Estão no laudo porque são interessantes, e porque muita gente tem curiosidade de ver o que o próprio genoma diz sobre coisas cotidianas.
Também estão declarados em grau D, que é onde devem estar: o efeito de cada variante é minúsculo e os estudos que as respaldam são pequenos ou não foram replicados. Um resultado daqui não habilita nenhuma decisão, e o laudo diz isso antes de mostrá-lo.
As duas coisas são verdadeiras ao mesmo tempo, e por isso a seção existe e vem fechada: é possível desfrutar de algo sabendo que não significa muito. O que não se pode é apresentá-lo com o mesmo peso que uma interação com um medicamento.
É assim que aparecem no seu laudo, com o nível declarado à frente. Os resultados do exemplo são fictícios.
É assim que aparecem no seu laudo: a seção vem fechada, com o grau declarado à frente, e abre apenas se você quiser. Os resultados do exemplo são fictícios.
Tudo isso está no seu laudo, e declarado
Cada achado leva seu nível de evidência, cada seção declara quanto o chip a cobre, e o que não pôde ser medido aparece com o motivo em vez de ser omitido.
Ver um laudo de exemplo
O laudo completo com dados fictícios, seção por seção.
Como o exame é feito
Da saliva ao resultado: o que é um microarray e como ele é lido.
Você paga on-line e a amostra é coletada na sede.
