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Genómico
Bancada de genética do Laboratorio Aclimu
Guia

Seu genoma, do zero

Nove páginas, uma por tela. Cada uma explica algo que você vai precisar para ler o seu laudo: o que é uma variante, o que a ancestralidade mede, em que uma condição mendeliana difere de uma poligênica, e o que é realmente um risco.

Role para baixo para avançar. Cada rolagem passa para a página seguinte.

01 · O que é o DNA

Três bilhões e duzentos milhões de letras

O seu DNA é uma sequência de quatro letras —A, C, G e T— repetida três bilhões e duzentos milhões de vezes.

Entre você e qualquer outra pessoa, mais de 99% dessas letras são idênticas. Tudo o que te distingue vive no resto. Cada posição onde as pessoas diferem é chamada de variante.

As duas fitas são as duas cópias que você herdou. Coincidem em quase todas as posições; as marcadas são as que variam entre as pessoas, e são essas as que o exame mede. Toque em uma.

Cópia materna
Cópia paterna
Seu genótipoA/G
rs4988235MCM6 / LCT

determina se a enzima que digere a lactose continua sendo produzida depois da infância.

Cada letra vai na cor da sua base: A, C, G e T. As posições destacadas são as que variam entre pessoas —as que o exame mede, e as únicas em que dá para tocar—; em todas as demais, as duas cópias trazem a mesma letra.

02 · Duas cópias de tudo

O seu resultado é sempre escrito em pares

Essas letras não estão soltas: vêm empacotadas em 23 pares de cromossomos —46 no total—, e de cada par você herda um da sua mãe e outro do seu pai. Por isso, em cada posição, você tem duas letras, não uma.

Quando as duas cópias são iguais, diz-se homozigoto; quando são diferentes, heterozigoto. Toda a genética que vem depois se apoia nessa diferença.

Cópia maternaCópia paternaCCC / C · homozigotoCTC / T · heterozigotoTTT / T · homozigoto

As três combinações possíveis em uma posição onde existem duas versões. É assim que o laudo escreve cada resultado: sempre com duas letras.

03 · O que você herda, e de onde vem

Herda-se em blocos, e os blocos são cortados

Você não herda letras soltas: herda trechos inteiros de cromossomo. Antes de passar uma cópia para você, cada progenitor cruza as suas duas cópias e monta uma mistura nova. Esse processo se chama recombinação homóloga, e ocorre em cada geração.

Como os pontos de corte caem em lugares diferentes em cada filho, com um irmão você compartilha 50% em média —os pares medidos vão de 37% a 61%— e o exame de um familiar não substitui o próprio.

E é por isso que dá para ler de onde vem cada trecho: a ancestralidade compara esses blocos contra populações de referência. Na Argentina, os painéis de populações indígenas são menores, e esse componente é estimado com menos precisão. Não é um defeito da sua amostra: é um limite da ciência disponível hoje.

Na geração 5:Europa95,7%América indígena4,3%

Cada ramo que entra é desenhado como uma cópia inteira de uma única região: é uma simplificação, porque uma pessoa real também vem misturada. Os nomes são regiões dos painéis de referência, não etnias. Quando os blocos ficam curtos demais, deixam de poder ser atribuídos a uma região: é aí que a ancestralidade perde precisão.

04 · Por que existem

Nenhuma variante está ali para te fazer mal

A maioria das variantes é o rastro de histórias de populações inteiras, não erros individuais.

Três coisas as tornam frequentes, e só a primeira tem a ver com serem úteis para alguma coisa. Olhe a forma de cada coluna: uma sobe e permanece, outra ziguezagueia sem direção até desaparecer, e a terceira dá um salto no dia em que um grupo se separa.

O caso mais claro é a lactose: tolerá-la na idade adulta é a variante nova, e ela se tornou comum apenas nas populações que criaram gado.

Cada quadrado é uma pessoa, cada linha uma geração; aceso significa que ela carrega a variante.

20 pessoas

Seleção

Deriva genética

Efeito fundador

620 de 20
100 de 20
314 de 20o grupo se separa

A variante dava uma vantagem. Quem a carregava deixou mais descendentes, então ela subiu e ficou.

Sem nenhuma vantagem por trás. Em populações pequenas o acaso sozinho basta para tornar uma variante comum — ou para apagá-la, como aqui.

Um grupo pequeno se separa e cresce isolado. O que ele carregava por acaso fica sobrerrepresentado para sempre.

Vinte indivíduos por geração, catorze gerações de cima a baixo. Os números vêm de rodar um modelo de Wright-Fisher, o modelo padrão de deriva genética.

05 · Herança mendeliana

Um único gene basta para decidir o resultado

Um gene é um trecho dessas letras com uma instrução dentro: quase sempre, como fabricar uma proteína. Em uma condição mendeliana o resultado depende de um único gene. São pouco frequentes, mas quando a variante está presente o efeito é decisivo e a conta é exata.

A forma mais comum é a recessiva: são necessárias as duas cópias com a variante, ou seja, os dois membros do casal precisam ser portadores. Com uma única cópia a pessoa é portadora saudável —sem sintomas e sem consequências— e é isso que a seção Portadores reporta.

Os paisOs quatro filhos possíveisAaportadoraAaAaportadorAa×AAsem a varianteAaportador saudávelAaportador saudávelaacom a condição

Cada círculo de baixo é um filho possível: herda uma cópia de cada progenitor, seguindo as linhas. Os quatro casos são igualmente prováveis, e a conta vale para cada gravidez separadamente.

25% com a condição em cada gravidez
50% portador saudável · 25% sem a variante

Com apenas um dos pais portador, nenhum filho tem a condição: todos os que herdarem a variante serão portadores saudáveis. Por isso a triagem que importa é a do casal, não a individual.

Fibrose cística, atrofia muscular espinhal, talassemias.

Experimente desmarcar um dos dois progenitores, e alternar entre recessiva e dominante: são os dois padrões que o texto explica, e o desenho se refaz com cada um.

06 · Um exemplo mendeliano

Uma posição decide se você digere lactose

A enzima que digere a lactose deixa de ser produzida depois da infância em quase todos os mamíferos, e em boa parte das pessoas. Que ela continue sendo produzida na idade adulta é o que é novo, e depende de uma única posição.

É exatamente o mecanismo mendeliano da página anterior, com uma diferença: aqui basta uma única cópia com a variante para continuar produzindo a enzima. Por isso há três resultados e não dois.

Serve para ver a regra sem o peso de uma doença: um gene, três genótipos possíveis, três resultados que se distinguem.

rs4988235MCM6 / LCTtolerância à lactoseDominante · basta uma cópia
Lactase persistente (intermediária)
Lactase, a enzimaLactose: um dissacarídeo, glicose + galactose
A carga de lactose é a mesma nos três genótipos. Com este, a lactase disponível hidrolisa 3 de 6 porções; o restante chega sem hidrolisar ao intestino grosso, onde a microbiota o fermenta.
Uma única cópia da variante já basta para continuar produzindo lactase. Em geral há tolerância, com sintomas possíveis diante de cargas altas.

Uma única posição do genoma decide as três, e com o padrão dominante da página anterior: o heterozigoto —uma só cópia com a variante— já tolera. Por isso esta característica tem nível de evidência alto: o mecanismo está descrito e o efeito é medido diretamente.

A mesma lógica da página anterior sobre uma característica cotidiana em vez de uma doença. No laudo, esta é a seção de Nutrigenética; o álcool funciona igual, com ALDH2.

07 · Herança poligênica

Milhares de variantes mínimas, e daí sai um percentil

Diabetes, infarto, hipertensão. Aqui não é um gene que decide: milhares de variantes contribuem com um empurrão mínimo cada uma, sobre tudo o que não é genético.

Muitos efeitos pequenos e independentes somam-se sempre na mesma forma, um sino, então aqui não há uma conta exata como os 25 % do quadro de cruzamento: há uma posição. O escore soma o peso de cada variante que você carrega, é comparado com uma população de referência, e isso dá um percentil. Contra qual população importa: a enorme maioria destes escores foi ajustada em coortes de ancestralidade europeia, e transferem pior para populações miscigenadas como as sul-americanas. O seu laudo ajusta o percentil pela sua ancestralidade medida e diz, escore por escore, o quanto dela está representado.

Repare na largura da faixa: o percentil vem com um intervalo, e o laudo sempre o mostra. Na população geral, o risco ao longo da vida desta condição é 10,5% — por isso o laudo fala de quantas pessoas em cem e não de quantas vezes mais: “o dobro” pode ser de 2 a 4 em cada 100, ou de 30 a 60.

Diabetes tipo 2as mais bem descritas
genótipoo que contribui neste caso
  1. TCF7L2×1,40
  2. CDKN2A/B×1,20×1,20
  3. FTO×1,17
  4. KCNJ11não multiplica
  5. IGF2BP2×1,14
  6. PPARG×1,14×1,14
Quanto estas seis multiplicam juntas×3,49
×1,00×8,48

×8,48 é o teto destas seis em cópia dupla, não o do escore.

…e 1.068.160 mais no escore, quase todas menores que a última da lista.

A letra destacada é a variante, e multiplica uma vez por cada cópia. Toque em qualquer genótipo para alterá-lo.

o caso do laudo de exemplo
1025507590percentil 786687percentil na população

Percentil 78: 78 de cada 100 pessoas de ancestralidade semelhante têm um escore mais baixo. O sino não muda ao tocar nos genótipos acima: o percentil sai de um milhão de posições com as suas frequências na população, não destas seis. Não é uma probabilidade — é uma posição, com um intervalo de 66 a 87 por cima.

Cada número é por quanto uma cópia dessa variante multiplica o risco, segundo estudos replicados. Não são as que compõem o escore: são as mais bem descritas do traço.

08 · Quanto respaldo tem

Nem todos os achados valem o mesmo, e o laudo diz isso

Cada achado do laudo vem com uma letra ao lado. Não é um enfeite: é quanto respaldo aquela afirmação tem, e muda por completo o que se pode fazer com ela.

Em A há uma diretriz profissional que diz o que fazer, e por isso farmacogenômica e portadores podem mudar uma conduta médica. Em B a associação é firme, mas acrescenta pouco ao que já se sabe pela clínica.

Em C o achado está replicado e, ainda assim, ninguém demonstrou que conhecê-lo melhore um desfecho. E em D é exploratório: interessante, sem implicação clínica.

  1. A
    Uso clínico estabelecidoFarmacogenômica · Portadores · parte da Nutrigenética

    Existe uma diretriz profissional que indica o que fazer.

    Clopidogrel e CYP2C19: a diretriz CPIC diz quando convém outro antiagregante.

  2. B
    Respaldo sólidoAncestralidade · Risco poligênico

    A associação é firme, mas acrescenta pouco ao que já se sabe pela avaliação clínica.

    Diabetes tipo 2: o percentil é firme, e ainda assim a idade e o peso pesam mais.

  3. C
    Sem mudança de conduta demonstradaParte da Nutrigenética

    Replicado, sem evidência de que conhecê-lo melhore um desfecho.

    Metabolismo da cafeína: replicado, sem evidência de que sabê-lo mude algo.

  4. D
    ExploratórioEsporte · Pele · Longevidade

    Sem implicação clínica. Entra por interesse, não por utilidade.

    Tipo de fibra muscular: associa-se a um perfil, e o treino pesa muito mais.

A barra mede quanto respaldo há por trás de cada degrau. Não são quatro caixas equivalentes: entre a primeira e a última há uma queda real, e o laudo a declara em vez de apresentar tudo igual.

A letra ao lado de cada resultado diz ali mesmo o que está medindo, porque não é a mesma coisa em todas as seções: aqui e nos fármacos mede acionabilidade; em Predisposições e Portadores, a confiança de revisão daquela variante no ClinVar; no Risco poligênico, quanto do escore depende da ancestralidade. Leia sempre a letra junto com o seu texto.

A mesma variante pode aparecer com nível A em uma seção e com nível D em outra: o que muda não é a variante, e sim quanta evidência há por trás do que se afirma sobre ela.

09 · Esporte, pele e longevidade

A parte que é para olhar, não para decidir

Tipo de fibra muscular, resposta da pele ao sol, percepção do sabor amargo. Estão no laudo porque são interessantes, e porque muita gente tem curiosidade de ver o que o próprio genoma diz sobre coisas cotidianas.

Também estão declarados em grau D, que é onde devem estar: o efeito de cada variante é minúsculo e os estudos que as respaldam são pequenos ou não foram replicados. Um resultado daqui não habilita nenhuma decisão, e o laudo diz isso antes de mostrá-lo.

As duas coisas são verdadeiras ao mesmo tempo, e por isso a seção existe e vem fechada: é possível desfrutar de algo sabendo que não significa muito. O que não se pode é apresentá-lo com o mesmo peso que uma interação com um medicamento.

  • Tipo de fibra muscular

    R / X
    Misto

    Uma cópia de cada variante. Associa-se a um perfil intermediário entre força e resistência, com um efeito pequeno frente ao treino.

    Nível D · exploratórioACTN3
  • Percepção do sabor amargo

    PAV / AVI
    Percebe

    Detecta o amargor de compostos como o do brócolis. É a característica com a qual se descobriu que o gosto tem uma base genética.

    Nível D · exploratórioTAS2R38
  • Sensibilidade ao dano solar

    C / T
    Aumentada

    Associa-se a pele que se queima antes. O protetor solar e a sombra movem isso muito mais do que a variante.

    Nível D · exploratórioMC1R
  • Cafeína como auxílio ergogênico

    A / A
    Metabolizador rápido

    Em metabolizadores rápidos descreveu-se algum benefício em resistência. A evidência é pequena e nem sempre se replicou.

    Nível D · exploratórioCYP1A2
  • Espessura do cabelo

    T / T
    Cabelo mais fino

    A variante que engrossa o cabelo é frequente no Leste Asiático e em populações originárias americanas. Esta amostra não a carrega.

    Nível D · exploratórioEDAR
  • Tipo de cerume e odor corporal

    G / G
    Cerume úmido

    Uma única posição decide as duas coisas ao mesmo tempo, porque o mesmo transportador está na pele e no ouvido. É uma das poucas características em que uma variante explica quase tudo.

    Nível D · exploratórioABCC11

É assim que aparecem no seu laudo, com o nível declarado à frente. Os resultados do exemplo são fictícios.

É assim que aparecem no seu laudo: a seção vem fechada, com o grau declarado à frente, e abre apenas se você quiser. Os resultados do exemplo são fictícios.

Para continuar

Tudo isso está no seu laudo, e declarado

Cada achado leva seu nível de evidência, cada seção declara quanto o chip a cobre, e o que não pôde ser medido aparece com o motivo em vez de ser omitido.

Reservar o exame ARS 159.000

Você paga on-line e a amostra é coletada na sede.